Сухие пробитики, в отличии от жидких, содержат малое количество полезных метаболитов бактерий, формирующих нормальную кишечную среду. Они бедны факторами роста и витаминами – продуктами синтеза бактерий. От момента попадания бактерий сухого пробиотика в организм до начала оказания ими эффекта проходит длительный срок. За 5-10 часов, которые бактериям требуются для активации, может произойти их эвакуация из кишечника вместе с кишечным содержимым. Кроме того, для получения активной фазы требуется ещё 12-18 часов.
Жидкие пробиотики находятся уже в активной фазе, поэтому начинают действовать сразу после того, как оказываются в кишечнике. Уже содержат продукты жизнедеятельности бактерий, в том числе витамины и летучие жирные кислоты. Обладают выраженной антагонистической активностью и способностью к адгезии к слизистой оболочке кишечника, что способствует тому, что бактерии способны активно колонизировать кишечник уже через 1-2 часа после попадания в организм.